Travaux Pratiques de Microbiologie

Description complete de cette serie des travaux pratiques


Resume des exercises

Jour 1

Bacteries de reference utilisees dans ces exercises:

Exercices

  1. Introduction a la microbiologie et les buts du TP (1 pt)
  2. Identification des protists (eucaryotes) de reference (1 pt):
  3. La boue d'une station d'epuration Decrivez des organismes eucaryotes: morphologie, organites, mobilite, etc. Utilisez le classeur pour identifier les organismes. (1 pt)
  4. Melange bacille/coque present dans un lac proche Chaque groupe recoit un melange de 2 souches, une bacille et une coque (E.coli, S.aureus ou K. pneumoniae, M.luteus). Etalez une goutte du melange sur une boite de petri pour isoler les 2 souches et incubez au moins 24h a 37C. Observez les colonies sur la boite de petri et decrivez les colonies: la forme, les bords, la surface, la transparence, la couleur. Est-ce qu'il y a 2 types des colonies differentes? Isolez une colonie de chaque type, l'etalez sur une nouvelle boite de petri, et incubez au moins 24h a 37C (protocole=0.5 pts, description des resultats=0.5 pts).
  5. Bleu de methylene Suivez et notez le protocol et faites un description chaque bacterie de reference (6 souches) et les 2 souches du lac (protocole=0.5 pt, description des resultats=0.5 pt).
  6. Coloration de gram Decrivez la coloration de gram de chaque souche de reference et de les 2 souches du lac. Les gram+ sont pourpre et les gram- sont rose (protocole=0.5 pt, description des resultats=0.5 pt)


Jour 2

Exercices

  1. Controle de qualite de yaourt: Un yaourt de bonne qualite a ~10^9 cellules vivantes par gramme de 2 souches, Streptococcus thermophilus et Lactobacillus bulgaricus , mais les cellules meurent avec le passage du temps. Il y a deux echantillons de yaourt et le but de cette exercise et de determiner quel est depasse. Faites une series de dilutions de yaourt et ensemencez les 3 dernieres dilutions sur les boites MRS et M17 (milieu pour favoriser la croissance des lactobacilli). Incubez au moins 24h a 37C. Identifiez et comptez les colonies des 2 types des bacteries presentes dans le yaourt. Multipliez le nombre des colonies par la dilution pour quantifier si le yaourt etait depasse (0.5 pts pour le protocole d'isolement, 1 pt pour les resultats et identification).
  2. Echantillons microbiologique de l'environnement: Determinez un protocole pour isoler les microbes des deux endroits environnementaux (ie la salive, les doigts, la surface d'une table) sur les boites de petri de LB. Incubez les boites de petriz au moins 24h a 37C. Decrivez et comptex les colonies (0.5 pt pour le protole et 1 pt pour la description des resultats).

Jour 3

Exercises

  1. Activites bactericides des anti-bacteriens: Suivez les protocoles pour tester l'effets de 2 antibacteries (UV, ethanol, l'eau de javel, ou l'eau bouillante) chez E.coli. Incubez au moins 24h a 37C. Combien des colonies ont pousse dans chaque traitement des anti-bacteriens? (0.5 pts pour le protocole et 1 pt pour les resultats).

Jour 4

Exercices

  1. Les milieux selectifs pour identifier les bacteries: Ensemencez une coque et une bacille sur une boite de petri de chaque milieu. Incubez les boites au moins 24h a 37C. Decrivez les resultats (croissance et couleurs) de chaque traitement (protocole=0.5 pts, resultats=1 pt).
  2. Effets des antibiotiques sur E. coli: Etalez une suspension d'E. coli sur une boite de petri de LB et placez les pastilles imbibees d'antibiotique sur la boite. Incubez la boite au moins 24h a 37C. Decrivez le protocole et les resultats.(protocole=0.5 pts, resultats=1 pt).
  3. Mesurement de la concentration minimale inhibitrice (CMI) d'ampicilline sur E. coli: Inoculez les cultures d'E. coli avec une serie de dilution d'ampicilline de 1 mg/ml a 1 ng/ml (chaque tube avec une concentration d'ampicilline 10 fois diluee). Incubez les tubes a au moins 24h a 37C. Quelle est la CMI d'ampicilline sur E. coli? Decrivez le protocole et les resultats. (1 pt).

Jour 5

Exercices

  1. Test API 20E: analyses du metabolisme des enterobacteries gram-negatifs . Ce dispositif se compose de plusieur puits contanant des substrats deshydrates pour faire ces tests biochimiques du metabolisme. Incubez le dispositif au moins 24h a 37C et decrivez les resultats (protocole=0.5 pts, resultats=1 pt). Voici description de la preparation et lecture du test ApI 20E.
  2. Reaction a la catalase (H2O2 -> H2O + O2): les gram negatifs sont presque tous catalase plus; les gram positifs Streptococcus et Lactobacillus sont catalase negatif (1 pt).
  3. Reaction a l'oxydase: test pour la chaine respiratoire qui fonction avec le cytochrome C membranaire. Reactif TMPD s'oxide en donnant un electron au cytochrome C et TMPD devient bleu. Pseudomonas est Ox+ et les enterbacteries sont OX-.
  4. Discussion Conclusions et l'identification des 2 bacteries (une bacille et une coque) du echantillon du lac. (4 pts)